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Qu’est-ce qu’une bactérie ?

Les bactéries sont des micro-organismes vivants, au même titre que les virus et les champignons. Elles ont été découvertes à la fin du 17ème siècle par Anthoni Van Leeuwenhoek, naturaliste hollandais, qui inventa la microscopie.1,2

DÉCOUVERTE DES BACTÉRIES ET GÉNÉRALITÉS

Les bactéries sont très nombreuses et ont souvent été considérées comme des agents pathogènes et agressifs, responsables de maladies plus ou moins graves. Mais, contrairement au virus, ce n’est pas toujours le cas… En effet, le corps humain est colonisé par de nombreuses bactéries qui constituent la « flore commensale».2 Par exemple, au niveau du système digestif, le microbiote intestinal, largement impliqué dans les processus de digestion et de défense de l’organisme, est composé d’environ mille milliards de bactéries. Certaines de ces bactéries sont utilisées dans l’alimentation ou dans certains médicaments pour rééquilibrer le microbiote et rétablir une fonction digestive normale (suite à des épisodes de diarrhées…).3

LA MORPHOLOGIE BACTÉRIENNE

Les bactéries mesurent entre 0,5 et 10-15 μm. Ce sont des organismes procaryotes qui ne possèdent pas de noyau, mais un ADN chromosomique circulaire situé dans le cytoplasme. De nombreuses bactéries contiennent une autre structure d’ADN extra-chromosomique, appelée plasmide.

Elles sont entourées d’une paroi complexe et possèdent souvent des flagelles.2

Schéma d’une bactérie

LA CLASSIFICATION BACTÉRIENNE4

Il existe différents types de classifications des bactéries.

La classification de Linné permet de distinguer différents niveaux : le règne, l’embranchement, la famille, le genre et l’espèce.1

Chaque espèce se distingue par des caractéristiques métaboliques et morphologiques : les cocci seront plutôt courts et sphériques, les bacilles en forme de bâtonnet, d’autres peuvent être incurvés ou spiralés…1,2 En ce qui concerne les noms, le premier mot (en italique et commençant par une majuscule) correspond au genre, le deuxième (en minuscule et aussi en italique) correspond à l’espèce : Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes, Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae...1

Une autre classification, fréquemment utilisée, correspond à leur réaction au contact de la coloration de Gram. Enfin, elles peuvent être classées en bactéries aérobies ou anaérobies, en fonction de leur besoin en oxygène pour survivre.1

Lorsque l’environnement leur est favorable, en termes de nutriments, température, pH, oxygène… les bactéries pourront alors survivre et se multiplier. Dans certaines circonstances, les bactéries peuvent avoir un pouvoir pathogène important et être responsables de maladies bénignes ou graves.1

CLASSIFICATION BACTÉRIENNE ET PRINCIPALES BACTÉRIES

COCCI GRAM POSITIF

  • Staphylococcus
  • Streptococcus
    • Streptocoque bêta-hémolytique
    • S. pneumoniae
    • S. pneumoniae
    • Autres streptocoques
      • S. mutans, S. oralis, S. salivarius, S. sanguis, complexe « milleri » (S. anginosus, S. constellatus, S.intermedius), S. gallotyticus (ex S. bovis)
  • Enterococcus
    • Enterococcus faecalis
    • E. faecium

COCCI GRAM NÉGATIF

  • Neisseria
    • N. gonorrhoeae
    • N. meningitidis

BACILLES GRAM POSITIF

  • Bacillus
    • Bacillus anthracis
  • Corynebacterium
  • Erysipelothrix
  • Listeria
  • Nocardia
  • Tropheryma whippelii

BACILLES GRAM NÉGATIF

  • Entérobactéries
  • typhimurium
    • Serratia
    • Shigella
      • Shigella sonnei
    • Yersinia
      • Yersinia
  • enterocolitica
  • Coccobacilles
    • Branhamella
    • Brucella
      • Brucella abostur
    • Campylobacter
    • Coxiella
    • Francisella
    • Haemophilus
    • Helicobacter
    • Kingella
    • Legionella
    • Moraxella
      • Moraxella catarrhalis
    • Rickettsia
  • Autres bacilles à Gram négatif :
    • Acinetobacter
    • Aeromonas
    • Bordetella
    • Burkholderia
    • Pasteurella
    • Pseudomonas
    • Stenotrophomonas
    • Vibrio

GRAM POSITIF

  • Actinomyces
  • Clostridium :
    • C. botulinum
    • C. difficile
    • C. perfringens
    • C. tetani
  • Peptococcus
  • Propionibacterium acnes

GRAM NÉGATIF

  • Bacteroides
  • Eubacterium
  • Fusobacterium
  • Porphyromonas
  • Prevotella

SPIROCHÈTES

  • Borrelia
  • Leptospira
  • Treponema
    • Treponema paalidum

    MYCOBACTÉRIES

    • M. avium
    • M. leprae
    • M. tuberculosis
    • M. africanum
    • M. kansasii
    • Mycobacteries

    AUTRES

    • Intracellulaires :
      • Chlamydia
        • Chlamydia psittaci
    • Sans paroi (mollicutes) :
      • Mycoplasma
      • Ureaplasma

    LEXIQUE DE BACTERIOLOGIE

    • Maladies infectieuses : les maladies infectieuses sont causées par des microorganismes pathogènes, tels que les bactéries, les virus, les parasites ou les champignons. Ces maladies peuvent se transmettre, directement ou indirectement, d'une personne à l'autre.5
    • Division cellulaire : la division cellulaire est le processus fondamental par lequel une cellule mère donne deux cellules filles identiques entre elles. La division cellulaire est un processus essentiel et vital pendant toute la vie de l’organisme adulte.6
    • Coloration de gram : il s'agit d'une méthode permettant de différencier les bactéries en fonction de leur capacité de coloration variant selon la composition de leur paroi.1 Ainsi, les bactéries colorées en bleu-violet seront dites à Gram positif et celles en rose à Gram négatif.2

    L’ACTUALITÉ ANTIBIO-RESPONSABLE

    1. JP. Flandrois. Bactériologie Médicale. Coll Azay. Puf. 2000.
    2. Heart T. Shears P. Atlas de poche de microbiologie. Médecine-Sciences-Flammarion. 2006.
    3. Goulet O. La flore intestinale : un monde vivant à préserver. Journal de pédiatrie et de puériculture (2009) 22, 102—106
    4. CMIT. Tableau des principales bactéries. In : E.PILLY : Vivactis Plus Ed ;2014 p 251.
    5. OMS. Maladies infectieuses. Disponible sur https://www.who.int/topics/infectious_diseases/fr/. Consulté le 14 Avril 2020
    6. Laurent MEIJER. Le cycle de division cellulaire et sa régulation. John Libbey Eurotext, 2006, hors-série, 41-53.